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關(guān)于菌落pcr


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1 如果你用了插入片斷特異的引物擴(kuò)增 , 那么可能是你連接時(shí)加的目的片斷過多 , 菌表面粘附了目的片段(我曾經(jīng)在沒有斑的地方蘸一下 , 也能P出目的帶) , 因此很可能出現(xiàn)假陽性 。這樣驗(yàn)證陽性克隆時(shí)建議你1〉用插入片斷兩端的測(cè)序引物(如M13F+R) , 做個(gè)PCR , 看能否擴(kuò)出目的大小的帶 , 如果有 , 說明肯定有片斷連入T載體;如果能用一個(gè)測(cè)序引物和一個(gè)你自己的引物擴(kuò)增就更好了 , 不但可以確定插入的方向還可以肯定是你的片斷插入 。2〉可以抽出質(zhì)粒后 , 酶切驗(yàn)證(這個(gè)最保險(xiǎn));但是質(zhì)粒很少時(shí) , 用你的特異引物 , 進(jìn)行較少循環(huán)數(shù)的擴(kuò)增 , 如果能拿到很亮的帶 , 那么很可能是陽性;因?yàn)樘豳|(zhì)粒后蘸附的片斷會(huì)很少 , 而質(zhì)粒作模板有利于目的基因的克隆2 如果你的菌中質(zhì)粒拷貝數(shù)很低 , 基因組比較復(fù)雜(如農(nóng)桿菌) , 有時(shí)會(huì)出現(xiàn)假陰性(不能P出帶) , 這時(shí) 。可以提質(zhì)粒后在PCR驗(yàn)證 。
【關(guān)于菌落pcr】

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